Der Protestantische Friedhof (richtiger wäre Friedhof für nicht-katholische Ausländer) entstand im 18. Jahrhundert, da es nach den Regeln der römisch-katholischen Kirche Bürgern und Reisenden anderer Konfessionen oder Religionen nicht gestattet war, auf den katholischen Friedhöfen der Stadt beigesetzt zu werden. Auf dem Friedhof wurden zunächst vor allem protestantische Engländer und Deutsche beigesetzt, es gibt daneben aber auch Gräber von orthodoxen und jüdischen Verstorbenen. Einige Persönlichkeiten sind hier zu finden, die wohl beeindruckendste Grabskulptur auf dem Friedhof ist der trauende Engel des amerikanischen Bildhauers William Wetmore Story, die er für das Grab seiner Frau Emelyn entwarf. Zwischen den Gräbern trifft man immer wieder zahme Katzen, die hier traditionell gefüttert werden.